Sameskolstyrelsen leds av en politisk nämnd bestående av fem ledamöter som är valda av Sametinget. Nämnden sammanträder minst fem gånger om året och biträds av ett kansli som finns i Jokkmokk och leds av en skolchef.
Ny nämnd har valts vid Sametingets plenum den 24 november 2025 i Bihtám (Piteå).
Valda ledamöter för mandatperioden november 2025–augusti 2029:
Paulus Kuoljok (Samelandspartiet), ordförande
Ingá Elisa Påve Idivuoma (Guovssonásti)
Sara Larsson (Min Geaidnu), vice ordförande
Kerstin Lingebrant Vinka (Jakt- och fiskesamerna)
Emelina Östergren (Landspartiet Svenska Samer)