Sameskolstyrelsen leds av en politisk nämnd bestående av fem ledamöter som är valda av Sametinget. Nämnden sammanträder minst fem gånger om året och biträds av ett kansli som finns i Jokkmokk och leds av en skolchef.
Valda ledamöter för mandatperioden augusti 2021–augusti 2025:
- Kerstin Lingebrant Vinka (Jakt- och fiskesamerna), ordförande
- Sagka Stångberg (Landspartiet Svenska samer), vice ordförande
- Lilian Mikaelsson (Landspartiet Svenska samer)
- Michael Teilus (Samelandspartiet)
- Lars Miguel Utsi (Guovssonásti)